Le vote a généralement lieu au scrutin secret lors d’une séance du conseil municipal ou communautaire[2][13]. Le plus souvent, un bureau de vote interne est constitué comme pour l’élection du maire : le conseil élit à bulletin secret les conseillers qui seront ses représentants au syndicat. Ce peut être un vote uninominal (chaque élu vote pour un candidat) ou, si les statuts prévoient plusieurs sièges, un vote de liste proportionnel à deux tours. En pratique, si tous les membres du conseil sont d’accord, ils peuvent lever le secret, mais cette dérogation requiert l’unanimité[2][5]. Les règles exactes (ordre du jour, quorum, vote électronique possible) suivent le droit commun des réunions publiques (quorum de présence, article L.2121-9 du CGCT, etc.).